Romanian Journal of Pediatrics Logo
  • Home
  • Aims & Scope
  • Standards
    • Instructions for authors
    • Instructiuni pentru autori
    • Peer-review protocol
    • Protocol peer-review
    • Open Access
  • Editorial Council
  • Peer-Review Council
  • EMC | CME
  • How to
  • SUBSCRIBE
  • Menu

Arhiva autor

  • About
  • Latest Posts

Liubov Vasilos

Latest posts by Liubov Vasilos (see all)

  • EVALUAREA RISCULUI GENETIC PENTRU ASTMUL BRONSIC LA COPII CU AJUTORUL SOFTULUI GENERALIZED MULTIFACTOR DIMENSIONALITY REDUCTION - 20/07/2015
  • EVALUATION OF GENETIC RISK FACTORS FOR CHILDHOOD ASTHMA USING GENERALIZED MULTIFACTOR DIMENSIONALITY REDUCTION SOFTWARE - 20/07/2015

Articole semnate de acelasi autor in Revista Romana de Pediatrie:

EVALUAREA RISCULUI GENETIC PENTRU ASTMUL BRONSIC LA COPII CU AJUTORUL SOFTULUI GENERALIZED MULTIFACTOR DIMENSIONALITY REDUCTION

SELECT ISSUE

Revista Romana de PEDIATRIE | Volumul LXIII, Nr. 2, An 2014
ISSN 1454-0398  |  e-ISSN 2069-6175
ISSN-L 1454-0398
DOI: 10.37897/RJP

Indexată BDI  |  IDB Indexed

DOAJ
Ebsco Host - Medline
DOI - Crossref

HIGHLIGHTS

Publicarea de articole științifice

Stimați cititori, vă reamintim că autorii primi ai articolelor științifice pot acumula 80 de credite EMC în urma publicării. Dacă un articol are mai mulți autori, cele 80 de credite [...]

PREMIU NAȚIONAL AUTORI

RJP și SRPed oferă anual Premiul Național pentru Știință și Cercetare - pentru autorii celor mai bune articole științifice publicate [...]

Plagiatul – în actualitate

Tema plagiatului este tot mai mult discutată în ultima vreme. Apariția unor programe performante de căutare și identificare a similitudinilor între texte [...]

EVALUAREA RISCULUI GENETIC PENTRU ASTMUL BRONSIC LA COPII CU AJUTORUL SOFTULUI GENERALIZED MULTIFACTOR DIMENSIONALITY REDUCTION

Olga Cirstea, Liubov Vasilos, Ala Cojocaru and Dorina Savoschin

REZUMAT

Astmul bronşic reprezintă o maladie multifactorială, fiind determinată de numeroase interacţiuni intergenice şi cu factorii de mediu. Metode statistice tradiţionale, utilizate pentru analiza rezultatelor studiilor caz-control, nu permit evaluarea profundă a riscului de dezvoltare a bolii asociat mutaţiior genice. Software-ul GMDR (Generalized Multifactor Dimensionality Reduction, versiunea Beta 0.9) a fost aplicat cu succes în studiile genetice la pacienţii cu cancer, hipertensiune arterială, diabet ş.a.

Obiectivul lucrării a constituit utilizarea programului computerizat GMDR în scopul evaluării rolului interacţiunilor intergenice asupra riscului de dezvoltare a astmului bronşic la copiii moldoveni.

Material si metodă. Studiul de tip caz-control a fost realizat pe un lot de 180 de copii: 90 de copii cu astm bronşic şi 90 copii sănătoşi în lotul de control, fiind comparabili după vârstă şi sex. Software-ul GMDR (versiunea Beta 0.9) a fost utilizat pentru ajustarea covariabilelor discrete şi cantitative. A fost evaluată asocierea riscului de dezvoltare a astmului bronşic cu un şir de polimorfisme genice: polimorfismul de deleţie a genelor GSTТ1 şi GSTM1; GSTP1 313 A > G; NAT2 481 C > T, 590 G > A şi 857 G > A; IL-4 -590 C > T; IL-4Rα Arg551Gln; TNFα -308 G > A; repetitivităţile ААТ ale genei NOS1 în intronul 20; CC16 38 G > A.

Rezultate. Analiza datelor în studiu cu ajutorul software-ului GMDR a permis identificarea combinaţiei de polimorfisme ale genelor-candidate pentru astmul bronşic (GSTT1+, NAT2 *5-*7/*5-*7, NOS1 <12/>12 şi IL-4 -590 C/C) care majorează de 3,6 ori riscul de dezvoltare a maladiei (OR = 3,61; CI 95% 1,45-8,99; p < 0,01).

Concluzii. Rezultatele studiului demonstrează faptul că interacţiunile genice interferează la diferite niveluri ale mecanismelor fiziopatologice de dezvoltare ale astmului bronşic la copii. Analiza modelelor de interacţiune prin aplicarea software-ului GMDR în grupul de studiu indică asocierea riscului de dezvoltare a maladiei în special cu polimorfismul genelor de metabolizare a xenobioticelor şi a genei implicate în producerea oxidului nitric la nivelul mucoasei căior respiratorii.

Cuvinte cheie: astm bronşic, copil, factor de risc, polimorfism genic, software-ul GMDR

Full text | PDF

Olga Cirstea

EVALUATION OF GENETIC RISK FACTORS FOR CHILDHOOD ASTHMA USING GENERALIZED MULTIFACTOR DIMENSIONALITY REDUCTION SOFTWARE

SELECT ISSUE

Revista Romana de PEDIATRIE | Volumul LXIII, Nr. 2, An 2014
ISSN 1454-0398  |  e-ISSN 2069-6175
ISSN-L 1454-0398
DOI: 10.37897/RJP

Indexată BDI  |  IDB Indexed

DOAJ
Ebsco Host - Medline
DOI - Crossref

HIGHLIGHTS

Publicarea de articole științifice

Stimați cititori, vă reamintim că autorii primi ai articolelor științifice pot acumula 80 de credite EMC în urma publicării. Dacă un articol are mai mulți autori, cele 80 de credite [...]

PREMIU NAȚIONAL AUTORI

RJP și SRPed oferă anual Premiul Național pentru Știință și Cercetare - pentru autorii celor mai bune articole științifice publicate [...]

Plagiatul – în actualitate

Tema plagiatului este tot mai mult discutată în ultima vreme. Apariția unor programe performante de căutare și identificare a similitudinilor între texte [...]

EVALUATION OF GENETIC RISK FACTORS FOR CHILDHOOD ASTHMA USING GENERALIZED MULTIFACTOR DIMENSIONALITY REDUCTION SOFTWARE

Olga Cirstea, Liubov Vasilos, Ala Cojocaru and Dorina Savoschin

ABSTRACT

Asthma is a multifactorial disease caused by numerous genetic interrelations and also gene-environment interactions. Traditional statistical methods applied for case-control studies in do not offer the possibility for in-depth analysis of the genetic risk because of the “dimensionality” problem. The Generalized Multifactor Dimensionality Reduction software was successfully applied in genetic studies of cancer, hypertension, diabetes, etc. The aim of our study was to use the GMDR software to analyze the role of genetic interrelations on asthma development in Moldovan children.

Materials and methods. The case-control study included 180 children: 90 children with asthma and 90 healthy controls comparable by age and gender. The GMDR software Beta 0,9 was applied to adjust for discrete quantitative data and covariates. Association of genetic polymorphisms (GSTТ1 and GSTM1 gene deletions; GSTP1 313 A > G; NAT2 481 C > T, 590 G > A and 857 G > A; IL-4 -590 C > T, IL-4Rα Arg551Gln; TNFα -308 G > A; (ААТ)n repetitions in intron 20 of the NOS1 gene; and CC16 38 G > A) with the risk of developing asthma was studied.

Results. Data analysis using the GMDR method resulted with identifi cation of a combination of four genotypes (GSTT1+, NAT2 *5-*7/*5-*7, NOS1 <12/>12, and IL-4 -590 C/C) that increases by 3.6 folds the risk of childhood asthma development (OR = 3.61; CI 95% 1,45-8,99; p < 0,01).

Conclusions. Gene-gene interactions interfere at different levels of pathophysiological mechanisms of childhood asthma development. Analysis of the interaction models generated by the GMDR software based on study data showed a signifi cant association between asthma risk and polymorphisms in two important groups of genes – xenobiotic-metabolizing genes and the gene responsible for nitric oxide synthesis in airway mucosa.

Keywords: asthma, child, risk factor, genetic polymorphism, GMDR software

Full text | PDF

Olga Cirstea


SEARCH

STANDARDE

  • Instructions for AUTHORS
  • Peer-review protocol

Submit article

Submit your article to the journal by using the form here:

Submit

Subscriptions

To receive the Ro Journal of PEDIATRICS, click here:

SUBSCRIBE
Publicare-RRPedia
Abonare_RRPedia

Partners

Partners logo

plic-maileditor@rjp.com.ro

Subscribe to the Newsletter

Articles from the journal are licensed under a 
Creative Commons Attribution 4.0 International License

 Terms & Conditions

Open Access Statement

Publisher : AMALTEA Medical Publishing House

Audiența vizată de conținutul acestui site este reprezentată de profesioniștii aparținând comunității medicale și farmaceutice din România și internaționale. Acest site este GDPR-friendly. Prin accesarea acestuia sunteți de acord cu termenele și condițiile. [ click ]     De acord
Contact

trimitere ARTICOLE
email: editor@rjp.com.ro  |  tel.: 0742.155.512, L-V 9.00-18.00

credite & ABONAMENTE
email: info@amaltea.ro |  tel.: 0742.155.511, L-V 9.00-18.00